長期低燒還見於病毒感染，主要見於嬰幼兒，多見於咽喉部感染，無全身表現。——般檢查均無明顯異常，也無呼吸道症狀，多為某次病毒感染高燒後，低燒較長時間不退。年長兒咽部鏈球菌或金黃色葡萄球菌感染時，也可表現為長期低燒，可作咽分泌培養，如能找到細菌，即可確診。如為鏈球菌感染，還可取血檢查抗鏈球菌溶血素(簡稱抗“O”)，如滴定度高，說明有過鏈球菌感染。如抗“O”增高明顯，還應想到風溼熱的可能，應注意有無關節痛或腫脹，皮膚有無環形紅斑，心臟有無改變，這些都是診斷風溼熱的依據。女孩長期低燒應注意泌尿系感染，可以檢查尿得到確定。
長期低燒也可能與感染無關，而是由其他病或其他原因所致。在血液病方面，白血病、再生障礙性貧血、溶血性貧血等可見長期低燒。
如果孩子還有貧血、出血、黃疸等表現，檢查一下耳血，即可找出是否與其有關。
長期低燒也可以是生理性的，即並非有病的表現。這種低燒多為37.2～37.5℃(腋下體溫)，孩子精神食慾好，無病症表現，通過各方面的檢查也沒有發現不正常。在這種情況時最好同時測量肛溫，如肛溫在38℃以下，則不應認為發燒(肛溫較腋下溫度高1℃)，對於小兒來講，這種低燒，也算是正常的。因為正常體溫的標準是根據多數人的數值，並非為絕對數值。
