一、西醫治療
慢性扁桃體炎的治療是長期的，堅持治療是很重要的一點。 保持口腔清潔，每天睡前刷牙，飯後漱口，以減少口腔內細菌感染的機會。
1、含漱法：可選用含碘片，每次1～2片，每日3～4次含化。用淡鹽水漱口，簡單又方便，可於飯後及睡前，取溫開水一杯，加少許食鹽，口感有鹹味即可，反覆漱口，每次5分鐘左右。
2、藥物治療：可長期服用維生素C，每次1片，每日3次。體質虛弱常易發作者，應在醫生指導下使用提高機體免疫力功能的製劑。非急性發作時，不要濫用消炎藥。
3、手術治療的選擇：一般可按照以下原則。
(1)扁桃體過度肥大，妨礙呼吸、吞嚥者。
(2)反覆急性發作，每年4～5次以上，有扁桃體周圍膿腫病史。
(3)長期低熱，全身檢查除扁桃體炎外無其它病變者。
(4)由於扁桃體炎而導致的腎炎、風：溼等病，應在醫生指導下撣期手術。除此之外，還有一些病人或病情不宜手術者。
(5)急性炎症期及患急性病、上呼吸道感染和有流行病的時期。
(6)造血系統疾病、凝血機能減退、高血壓、心臟病、肺結核等病人不宜手術。
(7)婦女月經期及經前3—5日不做手術，否則，術後咽炎症狀加重。
(8)有慢性咽炎的病人如不十分必要可不手術，否則，術後咽炎症狀加重。至於慢性扁桃體炎的病人具體何時手術為宜，最好請醫生幫助決定。
二、中醫藥治療
1、中醫認為慢性扁桃體炎與體質虛弱，臟腑虛損有關，主要與肺、腎陰虛有關，治療卜多用滋補肺腎，生津利咽的方法。常用方藥：玄參12克、麥冬10克、生地12克、知母10克、黃柏6克、桔梗10克、生甘草6克。有消化不良，不思飲食者加陳皮10克、砂仁6克、焦三仙各10克。四肢乏力，精神疲倦，大便溏洩者，則應改服中成藥參苓白朮丸，每次6克，每日2次。
2、扁桃體炎外用療法
中藥“扁咽消”(原名“扁炎消”)外貼療法
扁咽消使用效果及自測：
(1)觀察扁桃體顏色的變化，是使用扁咽消是否有效的很重要的指標。因為反覆發作的扁桃體炎，即使不急性發作，扁桃體的顏色也是發紅的，在貼藥過程中，會觀察到扁桃體顏色越來越淡。貼夠一定的療程，扁桃體的顏色與口腔粘膜一樣，就說明病灶清除，可停止用藥。
(2)觀察扁桃體大小的變化，是貼用扁咽消是否有效的次要指標。因為慢性炎症刺激扁桃體不斷增生、水腫，因此扁桃體炎會出現不同程度的腫大，外貼扁咽消後，可使因炎症造成的水腫消失，增生部分馬上不可能縮小，病灶清除後，會逐漸萎縮。
(3)觀察扁桃體伴隨症狀的變化，是貼用扁咽消是否有效的參考指標。如未貼藥時精神狀態差，食慾不好，睡覺打呼嚕等，在貼藥後症狀會逐漸減輕直至消失。
