在臨床上，有很多患者認為，只要患了尖銳溼疣就會癌變，加上本身對疾病的正確認識不足，造成患者心理極大的恐慌和壓力。其實不然，尖銳溼疣癌變的幾率是非常小的。
在某些自然的或實驗條件下，HPV病毒誘發的尖銳溼疣雖具有轉化為癌的傾向，然而這種轉化率病不高，不是所有的HPV感染者都會進展為癌。對於大多數患者而言，這種轉化還需要其它輔助因子的存在，例如吸菸、化學物質、宿主因素(例如HIV感染)和環境協同因素等，均對尖銳溼疣轉為惡性腫瘤有致突變及啟動作用。從臨床情況而言，尖銳溼疣的癌變趨向可能與以下幾種因素有關：
1、免疫功能降低或身體衰弱時的人體易患尖銳溼疣，而癌症的發生也與免疫功能有關，加上某些原因激活癌基因、免疫狀態改變和某些致癌物質作用，或皮損融合成片，長期不愈，形成潰瘍，浸潤糜爛，有繼發感染等慢性刺激，最終發生細胞突變而轉化為癌。
2、機體免疫功能下降，複發率高，採取多種有效治療措施，仍不能有效控制復發的皮損，可能向惡性化發展。
3、肛門、直腸及肛周等部位的巨大尖銳溼疣是高度進展性腫瘤，具有復發和惡變特性，尤其是向皮膚深層浸潤生長時，惡變的可能性更大。
然而一般尖銳溼疣患者，都是早發現早治療，不會發展成巨大尖銳溼疣;並且沒有合併其他慢性免疫性疾病，免疫能力並不是非常低下;不是長期激光強烈刺激或冷凍刺激局部，也不會形成皮損長期不愈、潰瘍、浸潤糜爛、和繼發感染等慢性刺激。所以是可以避免癌變侵向的刺激因素的。
就女性而言，一般只有感染了高危型的HPV，宮頸癌及宮頸上皮內才有可能發生高度病變或者癌變。但是，HPV的感染、潛伏是一個長期的過程，它可以潛伏在細胞內若干年。從HPV感染髮生病變到發展成宮頸癌，中間有大約10年左右的時間，在此期間只要婦檢做防癌篩查，都可以查出癌前病變，及時治療，避免悲劇的發生。
