1、指睪丸本身功能正常，但由於下丘腦和(或)垂體內分泌功能紊亂而繼發引起睪丸不發育或不生精。典型的病例如特發性低促性腺激素型性腺功能低減症。這是一種先天性疾病，下丘腦完全或部分缺乏釋放促性腺激素釋放激素的功能。人體存在一個下丘腦-垂體-睪丸性腺軸，一旦最高環節出現故障，必然連續影響到下面環節，垂體不能釋放促性腺激素，睪丸就不能發育，不能分泌雄激素，因而就不能產生精子。
2、如附睪結核、雙側附睪炎、雙側輸精管合併精囊缺如、射精管梗塞等。這樣睪丸雖然產生出大量精子，卻不能排到體外來，因此精液中無精子。
3、指睪丸本身因各種原因導致其喪失產生精子的能力。最常見的有克氏綜合徵，隱睪，還有支持細胞綜合徵，這種病人睪丸中只有支持細胞，而沒有生精細胞;精索靜脈曲張造成的睪丸萎縮、變軟、生精障礙。繼發於腮腺炎的雙側嚴重睪丸炎是散發性無精子症的原因之一。
