1、預防的關鍵是杜絕不潔性交。此外，公共浴堂的衛生也很重要，不提倡洗盆塘，衣服要單獨存放。
2、不飲酒。飲酒可以加重尿道的充血，使炎症更加急劇。
3、夫妻雙方有一方感染時，雙方應同時檢查治療。
4、患者未治癒前不得與任何人發生性關係。
5、個人預防感染與淋病類似。
6、性伴侶如有感染應同時治療。經治療，病人的症狀持續存在，或症狀消失後又復發，最可能的原因是性伴侶未經治療。未經治癒與性伴侶性交，病菌由未經治療的性伴侶再次傳給患者。須知有40%的非淋菌性尿道炎患者是沒有任何症狀。所以不但患者本身要治療，其性伴侶也應接受預防性的治療。
7、性生活時使用避孕套可減少非淋菌性尿道炎的傳播。
8、療期多飲水，以降低尿的濃度，減輕對尿道的刺激。
9、治療期間禁飲酒、勞累、熬夜及性生活。療前和療後也至少2周禁性交，這樣有助於疾病的徹底痊癒。
10、不與別人共用洗陰部的毛巾、盆具，不混用內衣褲。
11、家中有嬰幼兒者，要嚴格物品及手的消毒，以防通過密切接觸傳播。
12、排除焦慮心理，積極配合大夫治療。
