新鮮肛裂，經非手術治療可達癒合，如局部熱水坐浴，便後用1：5000高錳酸鉀溶液坐浴，可促使肛門括約肌鬆弛;潰瘍面塗抹消炎止痛軟膏(含地卡因、黃連素、滅滴靈等)，促使潰瘍癒合;口服緩瀉劑，使大便鬆軟、潤滑;疼痛劇烈者可用普魯卡因局部封閉或保留灌腸，使括約肌鬆弛。
陳舊性肛裂 經上述治療無效，可採用手術切除、包括潰瘍連同皮贅(前哨痔)一併切除，還可切斷部分外括約肌纖維，可減少術後括約肌痙攣，有利癒合，創面不予縫合，術後保持排便通暢，熱水坐浴和傷口換藥，直至完全癒合。近年來採用液氮冷凍肛裂切除術，獲得滿意療效，術後痛苦小，創面不出血，不發生肛門失禁等優點。
