流感病毒感染可由單純性轉變為肺炎或直接轉變為肺炎，肺炎是由流感病毒感染從上呼吸道擴散到下呼吸道而引起的。有報道稱，基礎性疾病的報告未經證實。
肺炎型流感的典型發病特點是持續高熱，迅速出現呼吸困難、發紺、劇烈咳嗽，並有泡沫狀粘液痰或痰中帶血；檢查發現兩肺呼吸音低，滿是雞冠狀，但無實體症狀。胸部X光片顯示雙側肺部有散在的絮狀陰影，從肺門向周邊擴散；表現與成人呼吸窘迫綜合徵（ARDS）一致，病人可能死於心力衰竭或外周循環衰竭。病程可長達3至4周。血氣分析顯示明顯缺氧。
流感病毒很容易從痰中分離出來，痰塗片革蘭氏染色可見到許多嗜中性多核粒細胞；但是，痰和血培養沒有顯示致病菌的生長，抗菌治療無效，死亡率可超過50%。嬰幼兒和老年人的流感常影響下呼吸道，尤其是導致肺炎，約有1/4因下呼吸道感染住院的小兒病例是由流感病毒引起的。老年人流感性肺炎和支氣管炎的發病率隨年齡增長而增加，從60-69歲年齡組的36%到70歲以上年齡組的高達73%。老年人的肺炎往往缺乏初始症狀，容易被忽視，而肺炎的出現往往伴隨著明顯的脫水、酸中毒或意識障礙等危急情況。
