對於非醫療專業人士來說，可能區別大三陽和小三陽有一些難度，因為涉及到一些專業的醫療診斷標準。
區別之一
檢測結果的不同大三陽是指表面抗原、乙肝e抗原和核心抗體檢測均是陽性。即乙肝五項的1、3、5項呈陽性(或+)者稱為大三陽小三陽是表面抗原、乙肝e抗體、和核心抗體檢測均是陽性。即乙肝五項1、4、5項呈陽性(或+)者稱為小三陽。
區別之二
病毒數量、複製程度的不同由於乙肝病毒的不同，大三陽患者體內有乙肝病毒的呈現活躍複製狀態，且其血液、唾液、精液、乳液、宮頸分泌液、尿液都可以具有傳染性，應注意肝功。若發現異常及時進行治療。
小三陽患者可分為兩種情況：一種是肝功能長期正常，稱之為“穩定性小三陽”傳染性低。另一種情況是肝功能檢查反覆異常，稱之為“不穩定性小三陽”主要是由於乙肝病毒發生變異，也有較高的傳染性。
區別之三：傳染性強弱的不同大三陽傳染性相對較強，同時演變成慢性乙肝的可能性也比較大。
小三陽傳染性相對較弱，同時演變肝硬化、肝癌的可能性相對較大些。
小三陽通常是由大三陽轉變而來，是人體針對e抗原產生了一定程度的免疫力。一般認為小三陽的傳染性較小。但對於一些e抗原和e抗體均為陰性的人，它所感染的乙肝病毒可能是已經產生突變的病毒株感染，它不能表達e抗原和e抗體，但是如果檢查HBV-DNA依然陽性，表示病毒血症存在，仍然具有傳染性，需要及時有效的採取治療措施。
