肝腫瘤的檢查中，血清學和影像學的不斷髮展為亞臨床肝癌的早期診斷提供了各種方法，臨床上把血清學診斷、影像學診斷稱為定位診斷，這些方法的綜合應用可提高診斷的正確率。本病的具體檢查方法如下。
一、甲胎蛋白(AFP)檢測
AFP對肝細胞其準確率達90%左右，其臨床價值如下。
1、早期診斷：能夠診斷亞臨床病灶，可在症狀出現8個月前左右做出診斷。
2、鑑別診斷：因89%肝細胞癌病人血清中AFP大於20ng/ml，因此甲胎蛋白低於此值又無其他肝癌證據者，可排除肝癌。
3、有助於反映病情好轉與惡化，AFP上升者表示惡化，下降者如臨床也改善則病情好轉。
4、有助於判斷手術切除的徹底以及預示覆發與否，術後AFP下降至正常值者示切除徹底，降而復升者提示覆發，也可在復發症狀出現前6～12個月做出預報。
5、有助於對各種治療方法做出評價，治療後AFP轉陰率越高，其效果越好。
AFP假陽性，並非所有AFP陽性的病人都患有肝癌，AFP假陽性主要見於肝炎、肝硬化，兩者佔假陽性病例的80%。此外還有生殖腺胚胎癌、消化道癌、病理性妊娠，肝血管內皮瘤、惡性肝纖維組織瘤等。AFP陰性病人的診斷，AFP陰性不能除外肝癌診斷時，可進行酶學檢查，其中較有臨床意義的是 α1抗胰蛋白酶(AAT)、γ-谷氨酰轉酞酶(γ-GT)、癌胚抗原(CEA)、鹼性磷酸酶(AKP)等，這些血清學的化驗結果在肝病病人都有可能上升，但都不是特異性。
