病原微生物感染：
許多病原微生物，如百日咳桿菌、結核桿菌等細菌及病毒、肺炎支原體、衣原體等引起的呼吸道感染，是兒童慢性咳嗽最常見的原因，多見於5歲以下的學齡前兒童。如果治療不及時，細菌或病毒向下蔓延就會產生肺炎，咳嗽不斷加重，並出現不同程度的發熱，體質較差或病情較重的兒童有可能出現休克或死亡。這類咳嗽呈刺激性乾咳，或伴少量白色黏痰，同時可能會有聲音嘶啞等，治療以抗感染為主。
氣管異物：
小兒咳嗽氣管異物是1~3歲兒慢性咳嗽要因這類咳嗽通常表現為陣發性劇烈嗆咳，同時會有呼吸音減低、喘息、窒息史等表現，也可僅表現為慢性咳嗽伴阻塞性肺氣腫或肺不張。睡覺時可用枕頭把寶寶的後背和頭撐起，防止分泌出的黏液滴落喉嚨造成窒息。
