由於目前沒有特效的抗病毒藥物，尖銳溼疣的治療必須採用綜合治療。
一、治療誘因：白帶過多，包皮過長、淋病。
二、提高機體免疫力。
三、應用抗病藥物。一般只要堅持規則的綜合治療都可治癒。
1、手術療法
對於單發、面積小的溼疣，可手術切除;對巨大尖銳溼疣，可用Mohs氏手術切除，手術時用冷凍切片檢查損害是否切除乾淨。
2、冷凍療法
利用-196℃低溫的液體氮，採用壓凍法治療尖銳溼疣，促進疣組織壞死脫落，本法適用於數量少，面積小的溼疣，可行1-2次治療，間隔時間為一週。
3、激光治療
通常用CO2激光，採用燒灼法治療尖銳溼疣，本療法最適用女陰、陰莖或肛周的溼疣。對單發或少量多發溼疣可行一次性治療，對多發或面積大的溼疣可行2-3次治療，間隔時間一般為一週。
4、電灼治療
採用高頻電針或電刀切除溼疣。方法：局部麻醉，然後電灼，本療法適應數量少，面積小的溼疣。
5、微波治療
採用微波手術治療機，利多卡因局麻，將桿狀輻射探頭尖端插入尖銳溼直達疣體基底，當看到就體變小、顏色變暗、由軟變硬時，則熱輻射凝固完成，即可抽出探頭。凝固的病灶可以用鑷子挾除。為防止復發，可對殘存的基底部重複凝固一次。
6、β-射線治療
我們應用β-射線治療尖銳溼疣取得了較為滿意的效果，該方法療效高，無痛苦、無損傷、副作用少，複發率低，在臨床上有推廣價值。
