根據中華人民共和國衛生部(2000年)性病治療推薦方案，生殖器皰疹治療方案是：
(1)抗病毒治療
①原發性生殖器皰疹
阿昔洛韋200毫克，口服，5次/日，連服7～10天;或伐昔洛韋300毫克，口服，2次/日，連服7～10天;或泛昔洛韋250毫克，口服，3次/日，連服5～10天。
②複發性生殖器皰疹 最好在出現前驅症狀或損害出現24小時內開始治療
阿昔洛韋200毫克，口服，5次/日，連服5天;或伐昔洛韋300毫克，口服，2次/日，連服5天;或泛昔洛韋125～250毫克，口服，3次/日，連服5天。
③頻繁複發患者 (1年復發6次以上)，為減少復發次數，可用抑制療法
阿昔洛韋400毫克，口服，2次/日;或泛昔洛韋125毫克～250毫克，口服，2次/日。
以上藥物均需長期服用，一般服用4個月到1年。
④嚴重感染 指原發感染症狀嚴重或皮損廣泛者。阿昔洛韋5毫克～lo毫克/千克體重，靜脈點滴，每8小時1次，用5～7天或直至臨床症狀消退。
(2)局部治療 保持患處清潔、乾燥。皮損處可外塗3%阿昔洛韋霜、1%噴昔洛韋乳膏和酞丁胺霜等。
