妨礙陰莖發育，影響性生活的和諧：
包莖會影響陰莖的生長髮育，在青春期由於陰莖頭被包皮緊緊包住，得不到外界的應有刺激，陰莖頭的發育受到很大束縛，致使性器官發育成熟後的陰莖頭冠部的周徑明顯小，影響性快感。成年人會由於包皮過長或包莖，影響正常性生活。特別是包皮口徑過小的男人，包皮上翻不能復原，包皮緊緊卡在冠狀溝處，成嵌頓包莖，痛苦不甚。嚴重時，龜頭會因血流不暢而發生水腫，甚至可發生龜頭壞死。
使陰莖發炎：
包皮內有豐富的皮脂腺，能分泌大量的皮脂。包莖或包皮過長時，使包皮內皮脂腺的分泌物不能排出，皮脂和尿中的沉澱物合成乳酪狀奇臭的“包皮垢”。包皮垢適宜細菌生長，故可引起陰莖頭及包皮發炎。病菌通過尿道還可以造成尿路感染。發生在尿道口的炎症，癒合後可引起尿道口狹小，造成排尿困難。
損害腎臟功能：
由於陰莖發炎，可以引起尿道口或前尿道狹窄，造成排尿困難。長期排尿困難，腎臟的功能就會受到損害。
有致癌的危險：
包皮過長和包莖，有誘發陰莖癌的可能。現代科學研究表明，包皮垢是一種致癌物質，據調查，85%-95%的陰莖癌患者，都是包莖或包皮過長。包莖和包皮過長，不僅影響自己的身體健康，如果和妻子同房，還會把包皮垢帶入陰道，刺激子宮，誘發子宮頸癌。因此，包莖及包皮過長的男子應當及早到醫院手術治療。作包皮環切術。對於不發炎的包皮過長，只要經常將包皮上翻清洗，也可不必手術。
