1.甲亢合併妊娠
甲亢多發生在育齡的女性，所以臨床上經常遇到一些甲亢合併妊娠的患者，由於抗甲狀腺藥物對胎兒有致畸作用，所以需要和醫生根據病情共同討論，決定胎兒的留或舍。妊娠甲亢患者是放射碘治療的禁忌證，需要繼續妊娠的甲亢患者多數採用藥物治療，儘量採用最小有效劑量，治療中儘量不要同時加用甲狀腺激素，每1～3個月需要測定遊離T4(FT4)、遊離T3(FT3)和TSH，而不是總T4和總T3。治療中需要將遊離T4維持在正常值的上限。
2.甲狀腺相關性眼病
甲亢多數是Gravs病，是一種屬於器官自身免疫病，器官自身免疫病常常會合並其他器官自身免疫病，甲亢患者常常合併突眼，突眼是眼眶(包括眼外肌和眼球后脂肪)的器官自身免疫病。臨床上除了Graves病患者可以表現突眼，其他一些甲狀腺自身免疫病，如慢性淋巴細胞性甲狀腺炎也可表現突眼，所以我們稱其為“甲狀腺相關性眼病”。甲狀腺相關性眼病和Graves病之間沒有直接關係，它們之間不是“父子”關係，而是“兄弟”關係，甲亢控制滿意對眼病有幫助，但並不是一定會好轉的。
