1、腦電圖檢查：一般認為，偏頭痛病人無論是在發作期或間歇期，腦電圖的異常發生率皆比正常對照組高，但是，偏頭痛病人的腦電圖改變不具有特異性，因為它可有正常波形。普通性慢波、棘波放電、局灶性棘波、類波以及對過度通氣、閃光刺激有異常反應等各種波形。小兒偏頭痛腦電圖的異常率較高，達9%～70%不等，可出現棘波、陣發性慢波、快波活動及瀰漫性慢波。
2、腦血流圖檢查：病人在發作期和間歇期腦血流圖的主要變化是兩側波幅不對稱，一側偏高或一側偏低。
3、腦血管造影檢查：原則上偏頭痛病人不需進行腦血管造影，只有在嚴重的頭痛發作，高度懷疑是否為蛛網膜下腔出血的病人才進行腦血管造影，以期除外有顱內動脈瘤、動靜脈畸形等疾患。無疑，偏頭痛病人腦血管造影絕大多數是正常的。
4、腦脊液檢查：偏頭痛病人腦脊液的常規檢查通常是正常的，一般情況下腦脊液的淋巴細胞可增高。
5、免疫學檢查：一般認為偏頭痛病人的免疫球蛋白IgG、IgA、C3及E花環形成可較正常人偏高。
6、血小板機能檢查：偏頭痛病人的血小板聚集性可升高。
