侵害肝臟
小三陽的影響是病毒對肝臟損傷，影響肝功能，出現食慾不振，渾身無力，很容易疲勞。嚴重的患者會出現面黃，鞏膜黃等症狀，甚至出現肝區疼痛。尤其是對於乙肝小三陽無症狀表現的患者來說，如果不進行保健和治療的話，體內病毒不斷的複製增多，從而造成體內乙肝病毒量變引起變異，臨床上很多患者惡化為肝硬化甚至肝癌。
誘發併發症
乙肝小三陽會對肝外組織產生影響，產生多種併發症。最近的研究發現，在肝外的很多器官組織中，也能檢測到乙型肝炎病毒抗原和乙型肝炎病毒脫氧核糖核酸。它們以免疫複合物的形式沉積於肝外的器官組織中，在臨床上可以引起很多疾病。對其他器官的侵犯有腎，膽，心臟等器官的侵犯，對關節，血液的侵犯。
損害心理健康
此病還會影響患者的工作和學習，對心理健康帶來困擾。因為大家現在都怕被小三陽傳染，存在著乙肝歧視。會造成很多生活和工作的不便，以及困擾。
小三陽的三種狀態是甚麼?
第一：如果小三陽DNA檢測呈陰性，肝功能、B超等均長期正常，說明病毒已不復制，無傳染性，所以無需隔離與治療。這種情況約佔小三陽患者總數的60%--70%，目前國內外尚無進一步治療的方法。一味追求轉陰而服用大量治療性中西藥物只會增加肝臟負擔，甚至招致不良後果。
第二：小三陽還有一種表現為乙肝病毒DNA低水平復制(PCR檢測<106)，肝功能正常或輕度異常，腹部b超脾稍厚，稱為慢性乙肝病毒殘留期。這種情況約佔小三陽患者總數的20%，目前國內對此種患者最容易忽視。如果不積極治療，任其發展，可導致肝硬化、肝癌。< p="">
第三：最嚴重的是乙肝病毒DNA高水平復制(PCR檢測>106)，肝功能不正常，稱為“e抗原陰性的慢性乙肝”。這種情況約佔小三陽患者總數的10%，它的特點是病毒複製活躍，傳染性強，是由於乙肝病毒變異所致。
