1.腹瀉西藥的選擇分為沙星類抗生素、止瀉劑、抗菌劑、調整菌群失調製劑4類。
沙星類抗生素：包括諾氟沙星、氟哌酸膠囊、環丙沙星等可防治感染，一定要遵醫囑或說明書服用，不可過量。
抗菌劑黃連素：主要成分鹽酸小檗鹼，對痢疾桿菌、大腸桿菌等菌引起的腸道感染有特效，用來治療腹瀉效果不錯，對痢疾的效果尤其明顯，對阿米巴原蟲引起的腹瀉也有作用，且物美價廉。每次0.3~0.4克，每日 2~3次。
調整菌群失調劑：整腸生、培菲康、媽咪愛、麗珠腸樂等，調整腸道菌群，起到提高腸道免疫力、保護有益菌生長、促進胃液分泌、增強消化功能等作用，適用於急性、慢性腹瀉，以及菌群失調引起的腹瀉;毒副作用較小，尤其適合老人、兒童和身體虛弱者。
吸附性止瀉藥：主要成分是蒙脫石微粒，是由天然礦物質中提取的，能夠在胃腸道形成黏膜保護層，可將細菌、病毒等吸附起來，有很好的收斂和保護腸黏膜的作用。適用任何類型的腹瀉，尤其對夏季常見的食物中毒性腹瀉有效。安全性很高，兒童也可服用。缺點是影響其他藥物以及微生物、礦物質的吸收，不能長期服用，止住腹瀉立即停藥。
