灰指甲是由一大類稱為致病真菌的微生物感染引起的，灰指甲的治療並不簡單，因為它容易復發。
灰指甲復發的原因
（1）灰指甲復發的原因外傷：
再次外傷導致致病真菌侵入甲板引起復發，這種情況一般比較少見。
（2）鞏固：
有些患者在指（趾）甲基本恢復正常形態時，即認為完全治癒，便停止用藥，在一段時間內沒有鞏固用藥，也會產生復發。
（3）指甲營養不良：
由於其他疾病和其他原因，灰指甲復發是由於指甲營養不良，使甲板對致病真菌的防禦能力下降，而使灰指（趾）甲復發。
（4）感染：
灰指甲治好了，但沒有同時治好甲癬，導致指（趾）甲再次被感染，這是甲癬復發的重要因素。
（5）化學物質刺激：
長期接觸汽油、油漆、洗滌劑、強鹼性肥皂等物質，改變了正常皮膚甲板表面的pH值和防禦功能，導致復發。這也是灰指甲復發的原因之一。
