一、男性包皮過長會細菌的繁殖基地，很容易引發包皮發炎，導致包皮龜頭炎疾病。這是因為包皮會分泌一些皮脂，這些皮脂由於包皮過長的原因，得不到有效的清除，加上尿液的混合，就很容易滋生細菌，導致包皮發炎，給男性健康亮起紅燈。
二、男性包皮過長還會影響性生活，出現性功能障礙，如：早洩。如果早洩不治療，還有可能會出現陽痿。這就會導致男性不能正常的性生活，久而久之，還會影響夫妻之間的感情，甚至引發家庭戰爭，嚴重的時候導致家庭的支離破碎。
三、男性包皮過長還會造成陰莖小的現象，不僅會影響性生活的和諧，還會給男性造成很大的心理影響。
四、男性包皮過長不僅危害自身的健康，還會危害到伴侶的健康，由於包皮垢內藏有大量細菌，性交時可侵入女方陰道內而引起感染。包皮垢的長期刺激也是導致女方一些婦科疾病。
包皮過長會導致滋生細菌、微生物，導致泌尿生殖感染，引起包皮龜頭炎、尿道炎等，若細菌逆行感染造成精囊炎、前列腺炎、睪丸炎等疾病。嚴重的話會併發陽痿早洩，男性不育等。在此建議包皮過長的男青年及時做割包皮手術，不必擔心手術會影響了陰莖的發育。恰恰相反，手術改善了龜頭隱匿的情況，如男性是在青春期進行的手術，往往通過切包皮還會促進陰莖生長，避免陰莖短小畸形的出現。1、遺傳基因。陰莖與其他器官一樣，其大小和形態都是受遺傳基因影響的。
2、發育與營養狀況。一般來說，成年男性體格健壯，其外生殖器，包括陰莖、陰囊的發育也較好，陰莖可能較為粗大，反之則可能小一些。但是需要指出的是，陰莖的大小不一定與身高成正比例。
3、肥胖。一些小腹部、恥骨聯合部、會陰部脂肪豐滿突出的男性，往往陰莖的發育欠佳，比起正常男性的陰莖會相對短小，在婚後可能會造成性生活不和諧。
4、其它方面。如內分泌紊亂、男性激素水平不足、陰睪或陰囊腫脹產生的陰莖“回縮”等，都可能造成陰莖短小。燒傷、外傷或先天性發育不良。如尿道下裂等所致的陰莖部分缺損或短小。
