紅斑狼瘡的病因複雜，但很多患者是一出生就患有該病，所以這種疾病與遺傳因素不無關係。
紅斑狼瘡是一種自身免疫性的疾病，而且它的發病是多種因素相互作用的結果，遺傳因素僅是其發病的因素之一，擔憂這一個因素，而沒有外界環境的刺激，紅斑狼瘡一般是不會發病的。現代醫學研究的結果認為：紅斑狼瘡產生的內在原因有遺傳基因和女性荷爾蒙，外在原因可能有紫外線、病毒感染、合成藥物、天然中藥、草藥、健康食品、食品內添加的色素等。
國外幾個較大型的研究機構發現，紅斑狼瘡的一等親屬(兄弟、姐妹、父母、兒女)較一般人稍微易發生紅斑狼瘡。進一步統計發現女兒約有百分之十，兒子約有百分之二的機會產生紅斑狼瘡。而異卵雙胞之一有紅斑狼瘡，另一位雙胞有紅斑狼瘡的機會為百分之五至十，與其它兄妹無甚差異，而同卵雙胞之一有紅斑狼瘡，另一位罹病機率高達三分之二。由上可知，紅斑狼瘡不一定會隔代遺傳。
