1、細胞學檢查，如穹窿穿刺、抽吸腹水進行細胞學檢查，在腹腔鏡檢查或剖腹探查時，可同時進行子宮直腸陷窩抽吸檢查，對惡性腫瘤的診斷有較高準確率。
2.腹腔鏡檢查，可直接看到腫塊的大體情況，可觀察整個盆腔和腹腔，在可疑部位進行多點活檢，吸取腹腔液進行細胞學檢查，可確定診斷和術後監測。但對腫塊巨大或粘連的患者禁用，且不能觀察腹膜後淋巴結，這是一個缺點。
3、放射學檢查，腹部平片是常用的檢查方法，對皮樣囊腫可顯示牙齒和骨骼；靜脈腎盂造影，可瞭解輸卵管是否移位、受壓、梗阻，鑑別遊離腎臟和腹膜後腫瘤；鋇劑灌腸，有助於巨大卵巢腫瘤、結核性腹膜炎和腹水，瞭解整個胃腸道情況。盆腔淋巴造影可以查看卵巢惡性腫瘤的淋巴轉移情況；CT掃描可以補充超聲沒有提示的病變。
4.超聲檢查是目前診斷卵巢腫瘤的重要方法，尤其是超聲現象，可以測量腫塊的部位、形狀和大小；囊性或實性；來自盆腔或腹腔；子宮或附件；並能識別卵巢腫瘤、腹水和結核性腹膜炎。任何直徑大於2釐米的腫塊都可以被測量，臨床診斷符合率大於百分之九十。
5.腫瘤標誌物檢查。卵巢囊腫是一種惡性卵巢腫瘤，與其他腫瘤一樣，可以產生和釋放抗原、激素和酶等產物，通過免疫學、生物化學等方法可以在患者的血清中測出，稱為腫瘤標誌物，提示體內有腫瘤存在。
