1.扁桃體是呼吸道的門戶，口鼻的細菌、病毒最先侵犯它。
2.扁桃體窩最易積存細菌和代謝物，是藏汙納垢的場所，只要溼度和溫度適宜，很容易被感染。
3.扁桃體小窩小皮稀疏，其間常可見淋巴細胞和其它遊走細胞，形成了“小窩上皮細網化”，而成為機體與病原體和毒素鬥爭的場所。
4.因扁桃體上有許多較深的小窩，如果患了扁桃體炎，病原體隱藏較深，極容易形成病灶，無論是口服用藥，還是靜脈給藥，作用不直接，不能把病灶有效清除。
5.扁桃體炎主要致病菌為乙型溶血性鏈球菌，葡萄球菌，肺炎雙球菌。腺病毒也可引起本病。細菌和病毒混合感染也不少見。細菌可能是外界侵入的，亦可能系隱藏於扁桃體隱窩內的細菌，當機體抵抗力因寒冷，潮溼，過度勞累，體質虛弱，菸酒過度，有害氣體刺激等因素驟然降低時，細菌繁殖加強所致。有時則為急性傳染病的前驅症狀，如麻疹及猩紅熱等。
