肺氣腫相當嚴重，可導致許多併發症：
1.自發性氣胸：自發性氣胸併發阻塞性肺氣腫的情況並不少見，大多是由於胸膜下氣胸破裂，空氣漏入胸膜腔。如果患者的基礎肺功能較差，氣胸緊張，即使氣體量不多，臨床表現也較重，必須積極搶救不可掉以輕心。肺氣腫患者的肺野透亮度較高，且常有大面積肺炎存在，體徵不夠典型，對侷限性氣胸的診斷有一定難度。
2.呼吸衰竭。阻塞性肺氣腫往往有嚴重的呼吸功能障礙。在某些誘因的影響下，如呼吸道感染、分泌物乾燥瀦留、不適當的氧療、過度應用靜脈製劑、手術操作等，通氣和呼吸功能障礙進一步加重，可誘發呼吸衰竭。
3.慢性肺心病：和右心衰竭低氧血癥和二氧化碳瀦留以及肺泡毛細血管床的破壞可引起肺動脈高壓。在心功能的代償期，沒有右心衰竭的表現。當呼吸系統病變進一步加重，動脈血氣惡化時，肺動脈壓力明顯升高，心臟負荷增加，加之心肌缺氧和代謝紊亂，可誘發右心衰竭。
4.胃潰瘍：屍檢證實，約18%～30%的阻塞性肺氣腫患者併發胃潰瘍。其發病機制尚不完全清楚。
5.睡眠呼吸障礙：正常人睡眠時通氣量可稍有減少，而阻塞性肺氣腫患者睡眠時通氣量減少較明顯。特別是當患者在清醒狀態下動脈血氧分壓已低至8.00千帕（60毫米汞柱）左右時，在睡眠中進一步降低則更為危險。睡眠質量下降的病人會出現心律紊亂和肺動脈高壓。
