1.子宮穿孔。妊娠週數越多，風險越大；流產次數越多，穿孔的機會越大。流產次數越多，穿孔的機會越大。其他情況，如子宮位置、形狀異常，或以前做過手術的子宮（如剖腹產或子宮肌瘤切除術），穿孔的機會更大。
2.宮頸或子宮內膜的粘連。如果醫生在流產過程中過於粗暴，很可能導致宮頸或子宮內膜的損傷和炎症，從而造成術後宮頸或子宮內膜粘連，引起月經異常，如無月經或月經量過少。嚴重的情況下，可能導致以後的不孕。
3、宮頸損傷：在人工流產過程中，如果不注意，宮頸口擴張速度過快，可能造成宮頸損傷，並造成以後懷孕容易流產的情況，特別是第一次懷孕或尚未生育的婦女更容易發生。
4.麻醉：如果麻醉師沒有掌握好麻醉方法，可能導致吸入性肺炎或呼吸停止。
5.不完全流產。如果手術不徹底，有少量的胎兒組織殘留在子宮內，可能影響子宮的收縮，造成持續出血或引起粘連、感染。最好再仔細做一次手術，將殘留的組織去除。子宮的位置或形狀異常通常更容易引起這種後遺症。
6.細菌感染。如果器械消毒不徹底，或醫生本人不注意無菌操作，就可能造成子宮內感染，甚至繼續向上感染，侵入輸卵管和盆腔，嚴重時可導致宮外孕或將來不孕。
