1) 中樞興奮性藥物 適用於合併有注意力缺陷和多動症狀的人。常用的藥物是哌醋甲酯。
（2）抗精神病藥物應小劑量、短時間使用，使用過程中應注意副作用，特別是錐體外系副作用
①利培酮對情緒症狀如衝動、攻擊性、激動、情緒不穩定、易怒及自閉症相關的精神症狀有效。
②氟哌啶醇對行為症狀如衝動、多動、刻板，和情感症狀如情緒不穩定和易怒，以及精神病性症狀有效，也有報道稱它能改善社會交往和語言發展障礙。
（三）阿立哌唑、喹硫平、奧氮平和其他非典型抗精神病藥物對控制患者的衝動、攻擊性和精神病性症狀也很有效。
（3）抗抑鬱藥 可以減少重複刻板行為、強迫症狀，改善情緒問題，提高社會交往能力，對使用多巴胺受體阻斷劑後出現的運動障礙如戒斷、遲發性運動障礙和抽搐也有效果。
選擇性5-HT再攝取抑制劑（SSRIS）對自閉症患者的行為和情緒問題有效。例如，6歲以上的患者可以嘗試使用舍曲林。
