從條件上講，巴塞杜氏病的治療還不可能。治療甲狀腺功能亢進症的目的是抑制甲狀腺激素的合成和釋放，或者減少或破壞阻礙激素分泌的甲狀腺組織。巴塞杜氏病的治療也要考慮到調整身體的免疫功能。
一一般治療
確診後，當甲狀腺功能亢進尚未得到控制時，儘可能取得病人的充分理解和密切配合，合理安排飲食，需要高熱量、高蛋白、高維生素、低碘；精神上要放鬆；適當休息，避免重體力活動。
第二種藥物治療
硫脲嘧啶，是目前我國和世界上許多國家對甲亢採取的主要治療方法。這種治療方法的特點：是口服藥物，患者容易接受；治療後不會造成不可逆的損害；但用藥療程長，需要定期隨訪；複發率高。即使合理、規範用藥，治療後仍有20%以上的複發率。
硫脲嘧啶的品種。臨床上通常選擇的順序是，甲巰咪唑-他巴唑、MMI、丙基硫氧嘧啶PTU、卡比姆唑-甲氧嘧啶和甲基硫氧嘧啶。PTU和甲基硫脲嘧啶的藥效比其他藥物低10倍，使用的劑量應大10倍。
藥物選擇。不同地區的醫生根據他們的實踐和經驗，對藥物的選擇也有所不同。在美國，通常選擇PTU，而在歐洲則更多地選擇MMI。在中國，PTU和MMI都被選中，前者可以減少循環中T4向T3的轉化，對孕婦更安全；後者的副作用更少，對甲狀腺激素合成的抑制作用更長，經驗表明，該藥可以每天給藥一次，患者的依從性更好。
輔助治療：普萘洛爾、碘酒和使用甲狀腺製劑。
三、手術治療
藥物治療後行甲狀腺次全切除術，效果好，治癒率達90%以上，但有一定的併發症發生幾率。
四 放射性碘治療
這種方法安全、方便，治癒率達85%-90%，複發率低，近年來在越來越多的國家用於治療甲亢。治療後症狀會慢慢消失，約有10%的患者會出現永久性甲狀腺功能減退。這是一種安全的治療方法，在世界範圍內使用的幾十年中，沒有發現選擇該療法的患者與未選擇該療法的患者相比，甲狀腺癌或白血病的發病率有所增加。
五、介入性甲狀腺栓塞術
這是20世紀90年代以來治療Graves病的一種新方法，自1994年報道第一例病例以來，在中國的一些地方已經開展。其方法是在數字減影X線電視下，將導管經股動脈送入甲狀腺上動脈，緩慢而彌散地注入聚乙烯醇、明膠海綿或與造影劑混合的透明質酸粉末的栓塞劑量，直至血流基本停止。一般來說，甲狀腺栓塞的面積可以超過80%-90%，這與次全手術切除的甲狀腺數量相似。這種治療的適應症是甲狀腺大，療效差或對抗甲狀腺藥物過敏；不適合手術或放射性碘；當甲狀腺非常腫大時也可用於手術前的治療。此外，對於甲狀腺腫大不明顯、有出血傾向、有明顯大血管硬化的甲亢患者，不建議首次使用。
六是中醫治療
對於中醫和針灸治療，對甲亢都有較好的療效，醫生對患者病情的診斷和鑑別，採用的方法和治療方法不同，藥物的選擇比西醫要重要許多倍。
