（1）腎絞痛。腎絞痛的出現往往表明上尿路存在腎結石，多在夜間或清晨突然發生。當結石阻塞尿路或處於下移狀態時，腎絞痛加劇。疼痛可放射到同側腹股溝和睪丸或大陰唇；當結石位於輸尿管的某一段，併發生局部炎症時，絞痛就會出現在這一段的局部；當結石向膀胱靠近時，腎絞痛又會出現尿頻、尿急和尿痛等綜合症狀。腎臟和胃腸道神經支配同屬腹腔神經叢，所以腎絞痛常可伴有噁心、嘔吐和腸麻痺綜合徵，容易與急性胃腸炎、急性闌尾炎、結腸炎或輸卵管炎混淆。
（2）血尿和膿液。急性腎絞痛常伴有明顯的肉眼血尿或顯微鏡下血尿。血尿在結石停止移動數天後消失。少數結石可能引起完全梗阻而無血尿。如果結石受到感染，血尿和膿尿可能同時發生。在某些情況下，腎結石長期受到刺激，導致腎臟上皮化生，然後形成磷上皮癌，這是一種持續的、強有力的血尿。
（3）急性梗阻性少尿和無尿。單腎（對側腎缺失或無功能）或雙側輸尿管結石的患者可引起急性梗阻性少尿或無尿。臨床指徵一般為急性梗阻側的腎區疼痛、少尿或無尿、尿毒症、心力衰竭、高血壓；高鉀血癥和大酸中毒。
（4）慢性腎衰竭：單腎或雙腎結石患者，若結石長期梗阻或合併感染，可形成慢性腎衰竭。腎區疼痛不明顯，甚至無自覺疼痛的患者，主要提示尿路感染、胃腸道綜合徵、貧血、心力衰竭、腹部包塊或不明原因的發熱，極易形成誤診。
