1. 病因不同：只有為人類乳頭瘤病毒感染蹠部皮膚黏膜引起發病，屬於病毒性皮膚病;雞眼是由於長期機械刺激引起角質層增生而發病，屬於物理性皮膚病。
2. 發病部位不同：蹠疣只於足蹠部;雞眼多發生於足蹠前中部、小指外側或拇指內側緣，也可見於足背及足跟，偶見於手部。
3. 皮損不同：蹠疣為黃豆大小或更大圓形或橢圓形灰黃角化斑塊，表面粗糙無紋，界限清楚，邊緣繞以稍高的角質環，中央凹陷;雞眼為豌豆大小淡黃色角質增生，呈圓形，表面光滑，與皮面平或稍隆起，境界清楚，酷似雞的眼睛。如果通過以上三個方面還區分不清，還有一個簡易的方法：取一次性手術刀片，在皮損處常規消毒，輕輕片去皮損角質層，如果發現出現有黑色小點或是點狀出血，一定為蹠疣。如果只見到邊界清楚稍透明的淡黃色角質增生，則為雞眼。
4. 傳染性不同：雞眼不傳染，蹠疣具有較強的傳染性。對於蹠疣的治療，醫院皮膚科採用微波和激光治療，對於一些難治性和複發性的疣採用同位素敷貼治療。
