正常情況下，陰道內的菌群比較平衡，酸鹼度比較均衡(pH值大概在3.8-4.5之間)。這種適宜精子暫時存留、通過的環境，是非常重要的，一旦這種環境被破壞，就容易發生不孕。
如果患了細菌性陰道炎，陰道的pH值會超過4.5，陰道內環境酸鹼度的改變會使精子的活動力受到抑制。另外，致病菌會吞噬精子，且患細菌性陰道炎時，陰道內分泌物大量增多，分泌物中含有大量的白細胞，這些都會妨礙精子的成活，使精子數量減少。精子本來數量少、活動度差者，就很有可能引起不孕。另外，一旦炎症上行，感染到宮腔，造成輸卵管炎、盆腔炎等，也會造成不孕。
細菌性陰道炎除了會給母體的生殖健康造成麻煩外，細菌嚴重感染的患者還會影響正常的工作和學習。在妊娠期間，這種危害自然增大，因為還會危及到胎兒，輕則引起胎動不安，重則導致早產、流產。
