英國胸科學會的指南中推薦常規療法治療支氣管擴張：患者教育，氣道分泌物清除(包括運動、理療和藥物治療)，氣道藥物治療(支氣管舒張劑和抗炎治療)，抗感染治療，必要時行手術切除。應依據疾病的嚴重程度、感染的病原菌種類、症狀的發生頻率、以及是否有能夠治療的合併症來實施個體化治療。通常採用階梯式的治療方法。
無論是慢性期還是急性加重期的治療，抗生素都必不可少。抗感染治療需要針對特定病原體，做到有的放矢，因此行痰標本培養來明確感染的病原體和其對相應抗生素的易感性相當重要。近期一項研究證實，支擴患者氣道細菌負荷量大於氣道和全身性炎症有關，短期和長期的抗生素治療均能降低炎症指標。
抗感染治療指徵
多種因素決定了支擴患者初始抗生素治療的時機。其中最重要的為患者咳嗽的嚴重程度和頻率、痰量和痰的性狀、是否出現咯血和急性加重的嚴重程度和頻率。若患者檢測到銅綠假單胞菌或非結核分支桿菌感染時，醫生應該開始抗感染治療。
抗生素既可作為慢性期治療的一部分，也可僅用於急性期治療。也有少量文獻報道，在首次檢測出銅綠假單胞菌或MRSA時，即開始抗生素治療以清除上述兩種細菌的感染。
抗生素的選擇和適用於哪些支擴患者，均應依照現有的證據和臨床指南/共識/臨床綜述來作出決定。抗生素治療應該個體化、治療方案應多元化，應對患者自身狀況來選擇必須的治療方案(包括清除氣道分泌物，舒張支氣管，抗炎治療)，從而改善患者症狀和生活質量，減少急性加重次數和儘可能延緩肺功能下降。
1. 現有文獻支持對頻繁出現急性加重的支擴患者採用長期大環內酯類藥物治療。
2. II期臨床研究表明，吸入氟喹諾酮類抗生素對支擴患者療效較好，3期臨床研究尚在進行當中。
3. 部分吸入性抗生素對支擴治療無效，最近發現的為氨曲南。
4. 尚需更多的證據來明確粘菌素吸入對存在銅綠假單胞菌慢性感染的支擴患者的療效。
