在臨床工作中，經常發現許多患者隨著治療時間的延長，病情穩定後思想放鬆，不按時吃藥、不按時隨訪，依從性由良好變差，CD4+T從穩定或正常到降低，甚至出現了與艾滋病有關的機會性感染等，致使治療失敗，而經檢測均存在耐藥現象，應引起足夠重視。
高效抗逆轉錄病毒治療(HAART)是目前控制艾滋病感染的病程、降低患者病死率、延長生存期、降低其傳染性的有效辦法。目前我國用來治療艾滋病的藥物主要有3類：核苷類逆轉錄酶抑制劑、非核苷類逆轉錄酶抑制劑及蛋白酶抑制劑，藥物種類少，可供選擇的藥物有限。融合酶、整合酶抑制劑尚未應用於臨床，臨床上通常採用聯合用藥的方法，包括兩種核苷類逆轉錄酶抑制劑和一種非核苷類逆轉錄酶抑制劑或者一種蛋白酶抑制劑，如果產生耐藥，療效就會明顯下降，導致臨床上抗病毒治療失敗。
艾滋病抗病毒治療存在一定的耐藥性。如果出現耐藥，一般發生在治療的2-3年後，依從性差是造成耐藥的主要原因。許多專家建議：更換藥物治療組合時多考慮選用含有增強作用的蛋白酶抑制劑，從而達到更好的病毒抑制效果。這是因為目前耐藥基因突變主要是針對核苷類逆轉錄酶抑制劑和/或非核苷類逆轉錄酶抑制劑，而對蛋白酶抑制劑的耐藥在臨床上目前尚比較少見。
有專家提醒，對從未使用過抗病毒藥物的患者也已存在著交叉耐藥現象，應引起臨床醫生的高度重視，需要加強耐藥監測，及時調整用藥，規範治療和管理，節省有限的藥物資源，以防止耐藥的傳播。
國內外大量研究證明，艾滋病耐藥變異株的出現是艾滋病患者臨床上抗病毒治療失敗的主要原因，建議更換藥物治療組合時多考慮選用含有增強作用的蛋白酶抑制劑。
