偏頭痛的治療目的是減輕或終止頭痛發作，緩解伴發症狀，預防頭痛復發。分為發作期治療和預防性治療。
1.發作期的治療
(1)輕中度頭痛單用NSAIs可有效，如無效再用偏頭痛特異性治療藥物。阿片類製劑如哌替啶對確診偏頭痛急性發作亦有效，因其具有成癮性，不推薦常規用藥，但對於有麥角類製劑或曲普坦類應用禁忌的病例，如合併有心臟病、周圍血管病或妊娠期偏頭痛，則可給予哌替啶治療以終止偏頭痛急性發作。妊娠期偏頭痛只能用阿片類如哌替啶治療，其他藥物會增加胎兒畸形風險或妊娠併發症。
(2)中重度頭痛可直接選用偏頭痛特異性治療藥物以儘快改善症狀，部分患者雖有嚴重頭痛但以往發作對NSAIDs反應良好者，仍可選用NSAIDs。
(3)伴隨症狀噁心、嘔吐是偏頭痛突出的伴隨症狀，也是藥物常見的不良反應。因此合用止吐劑(如甲氧氯普胺即胃復安肌內注射)是必要的，對於嚴重嘔吐者可給予小劑量奮乃靜、氯丙嗪。有煩躁者可給予苯二氮䓬類藥物以促使患者鎮靜和入睡。
發作期常用藥物：
①非特異性止痛藥：如非甾體類抗炎藥(NSAIDs)和阿片類藥物。
②特異性藥物：如麥角類製劑和曲普坦類藥物。非甾體類抗炎藥 (NSAIDs)：如對乙酰氨基酚、萘普生、布洛芬等。阿片類藥物：如哌替啶。麥角類製劑：麥角胺和二氫麥角胺(DHE)，能終止偏頭痛的急性發作。
曲普坦類：常用藥物有舒馬曲普坦、那拉曲普坦、利扎曲普坦、佐米曲普坦、阿莫曲普坦。
2.預防治療
適用於頻繁發作，尤其是每週發作1次以上嚴重影響日常生活和工作的患者;急性期治療無效，或因副作用和禁忌證無法進行急性期治療者;可能導致永久性神經功能缺損的特殊變異型偏頭痛，如偏癱性偏頭痛、基底型偏頭痛或偏頭痛性梗死等。包括藥物治療和非藥物治療兩個方面。
(1)非藥物治療主要是加強宣教，使患者瞭解偏頭痛的發病機制和治療措施，幫助患者確立科學、正確的防治觀念和目標，保持健康的生活方式，尋找並避免各種偏頭痛誘因。誘發因素有精神緊張、心理壓力、缺睡、噪音和強烈氣味。乳酪和紅酒等食物飲品。
(2)藥物治療
①β腎上腺素能受體阻滯劑，如普萘洛爾、美託洛爾;
②鈣離子拮抗劑，如氟桂利嗪、維拉帕米;
③抗癲癇藥，如丙戊酸、託吡酯、加巴噴丁;
④抗抑鬱藥，如阿米替林、丙米嗪、氟西汀;
⑤5-HT受體拮抗劑，如苯噻啶。其中，普萘洛爾、阿米替林和丙戊酸三種在結構上無關的藥物，是預防性治療的支柱，一種藥物無效可選用另一種藥物。
