採取預防為主，防治結合的方針。
1.局部治療
(1)點眼藥，磺胺及多種抗生素對沙眼衣原體均有抑制作用。其中以四環素、磺胺類藥效果較好。常用滴眼液有10%～30%磺胺醋酰鈉滴眼液，0.1%利福平滴跟液，0.05%～1%酞丁胺滴眼液，0.5%紅黴素眼藥水，點跟每日3～4次。睡前塗四環素、紅黴素或金黴素眼藥膏。要堅持3～6個月。
(2)乳頭較多者，可用海螵蛸棒或消毒紗布磨擦破壞乳頭，促進瘢痕形成。如濾泡較多者，可作沙眼濾泡擠壓術，術後繼續點藥。
2.全身治療
急性期或嚴重的沙眼應全身應用抗生素治療。目前阿奇黴素為治療沙眼的特效藥，首次口服500mg，以後每日250mg，共4日為一療程。
3.手術治療：主要針對併發症進行治療，如瞼內翻矯正術治療內翻倒睫，角膜移植術治療角膜混濁等。
中醫認為，本病初起系風熱外侵，治宜祛風清熱。方如銀翹散加減，藥有銀花、連翹、黃芩、生蒡子、劑芥等。如乳頭濾泡較多，充血明顯，證屬脾胃溼熱，治宜清脾瀉熱，方如清脾涼血飲，藥有劑芥、防風、白鮮皮、黃芩、梔子等。如病程較長，眼瞼肥厚，活動性病變與瘢痕兼見，證屬氣血瘀滯，治宜活血化瘀，方如歸芍紅花散，藥有當歸、赤芍、梔子、紅花、黃芩、生地、連翹等。
