目前對於女性尿道炎的治療要根據具體情況來選擇藥物，一般還是選擇抗菌素以及其他化學藥物來進行，對於尿路刺激徵明顯的病人，需要加入解痙劑等藥物來緩解症狀。
近來氟哌酸與磺胺藥物聯合應用，臨床效果滿意。支原體、衣原體或病毒感染，可首先使用四環素治療。對四環素若有耐藥性，則可改用紅黴素、甲基紅黴素或羅紅黴素等。以上藥物對支原體、衣原體有效。女性尿道炎患者還要在平時注意以下問題：
1、大量飲水，使尿量增加，排尿時可沖洗尿道分泌物。
2、使用鎮靜止痛解痙藥物，減輕疼痛。
3、注意休息，急性期短期內避免性生活。
4、抗生素治療，根據細菌培養和藥敏試驗選擇有效抗菌素。
