病因及常見疾病口腔潰瘍的發生是多種因素綜合作用的結果，其包括局部創傷、精神緊張、食物、藥物、營養不良、激素水平改變及維生素或微量元素缺乏。系統性疾病、遺傳、免疫及微生物在口腔潰瘍的發生、發展中可能起重要作用。如缺乏微量元素鋅、鐵，缺乏葉酸、維生素B12以及營養不良等，可降低免疫功能，增加口腔潰瘍發病的可能性;血鏈球菌及幽門螺桿菌等細菌也與口腔潰瘍關係密切。口腔潰瘍通常預示著機體可能有潛在系統性疾病，口腔潰瘍與胃潰瘍、十二指腸潰瘍、潰瘍性結腸炎、侷限性腸炎、肝炎、女性經期、維生素B族吸收障礙症、植物神經功能紊亂症等均有關。
治療原則對於口腔潰瘍的治療，以消除病因、增強體質、對症治療為主，治療方法應堅持全身治療和局部治療相結合，中西醫治療相結合，生理和心理治療相結合。需要引起注意的是，經久不愈，大而深的舌頭潰瘍，有可能是一種癌前病損，極易癌變，必要時做活檢已明確診斷。
