陰莖底部有幾個肉色的顆粒，還有一個黑色的顆粒。

那麼對於你描述的這種症狀過於簡單，所以不能為你做出準確的回答，對於這種情況建議你最好及時到醫院皮膚性病科進行相關檢查，確診後再給予治療，而且你還要注意，如果不是發生不良生活行為，那麼這種情況可能屬於黑色素細胞增生而引起的，也可能屬於人乳頭瘤病毒感染的低風險。

陰莖根部有幾個肉色的顆粒，還有一個黑色的，如果沒有症狀，一般不建議有效治療，只要每天睡前用清水清洗會陰部的生殖器，包括冠狀溝就可以了，一般對人體沒有影響，如果有擔心可以到皮膚科看看。

這種情況沒有見過照片，不能準確判斷，考慮是否是病毒刺激引起的局部贅生物或增生，這種情況建議到公立醫院皮膚科就診，讓專家檢查一下，就可以基本明確診斷，然後採取激光燒灼治療改善，注意養成健康行為