输血和移植配型
在临床输血中如果受血者血液含有针对供血者红细胞抗原的抗体，常导致严重的溶血性输血反应。输入的血液如含有针对受血者红细胞抗原的抗体则并无妨碍。这是因为输入的抗体立即被受血者的血液稀释，并为组织细胞所吸收的缘故。因此输血配型的原则是输入的红细胞不能具有受血者所缺的抗原。
临床器官移植中选择供者和受者时，必须使红细胞血型相配合,其原理与输血配型完全相同。ABO血型必须配合,Rh血型和P血型对移植物存活的影响尚无定论。在受者使用免疫抑制剂的情况下，未见其他血型系统有影响。
新生儿溶血症
这是胎儿与母亲红细胞血型不配合的结果。各种血型不配合都可引起新生儿溶血症，其中以Rh血型不配合引起的溶血症最为严重。在中国多见的是症状较轻的ABO新生儿溶血症。
亲子鉴定
根据血型遗传规律可排除亲子关系。例如O型母亲有一个A型的孩子，则B型和O型的男子不可能是这孩子的生物学父亲，余类推。
基因定位
某些血型基因座位在染色体上的位置已经确定，如Duffy、Rh、Scianna、Dombrock等座位在第一号染色体上，P座位在第6号染色体上，Colton和Kidd座位在第7号染色体上,ABO座位在第9号染色体上，Xg座位在X染色体上。 这些血型可以作为体细胞杂交基因定位研究中的重要的遗传标志。
疾病遗传研究
利用 Xg血型可确定X染色体的来源。例如特纳氏综合征女孩的性染色体是X0，假定该女孩是Xg(a+)，父亲也是Xg(a+)，而母亲是Xg(a-)，那么她的X 染色体必定来自父亲。又例如克氏综合征男孩的性染色体是XXY，假定该男孩是Xg(a+),母亲是Xg(a-)，那么他必定除了Y染色体外还有一条X染色体来自父亲。血型也可以作为遗传标志被应用于产前诊断。 例如已知ABH的分泌基因 (Se)和杜氏肌营养不良症的致病基因是X染色体上两个紧密连锁的基因，由于重组率很低，所以只要在有该病患儿娩出史的孕妇的羊水中检出ABH,就可判断其胎儿可能是患儿。
群体遗传学和人类学的研究
血型这一性状不受环境的影响而改变，身体中即使个别体细胞的血型基因发生突变，也不致影响到个体血型的改变，也不会发生血型的选择作用。因此血型在人群中的分布差别、同一种血型在不同民族和不同人种中的差别以及同一民族或同一人种中各种血型的频率都是群体遗传学和人类学的重要研究内容。
