此次世界性的猪流感病毒代号为h1n1亚型猪流感病毒新毒株，它包含人流感病毒、北美禽流感病毒和北美、欧洲、亚洲三类猪流感病毒的基因片段。h1n1亚型引起的猪流感已有近百年历史，美国于1918年首次报道猪流感。1918至1919年间，人群中流行着h1n1亚型引起的20世纪最具灾难性的流感，全球约20亿人染病，4000万人死亡，其中在疫情初期死亡的患者全都是身强力壮的青年人。当时即发现，猪群所表现的临床症状和病理变化与当时人群中流行的流感有许多相似之处，但直到1931年才分离并鉴定了第一株猪流感病毒h1n1。
20世纪每次人流感大流行的前后都有猪流感的发生和流行。大量的研究证实，引起1957年“亚洲流感”和1968年“香港流感”的h2n2和h3n2毒株都是重组病毒株，都经过猪体的基因重配过程。
1976年2月美国新泽西洲迪克斯堡新兵营中发生了一起猪(h1n1)亚型毒株引起的流感爆发事件，约200余人被感染，一人死亡。当时福特总统欲想连任，亲自批准1.35亿美元制备猪流感疫苗，用于全民免疫接种，而其他国家均持观望态度，结果美国推测失误，疫苗也以失败而告终，因此引起许多异议和诉讼。福特为竞选总统而批准此冒险计划，养猪场提出抗议，要将猪流感改为新泽西洲流感以免居民谈猪色变。本次流感和病原学分析表明，猪型流感病毒是由猪直接传播人。
过去人感染猪流感病毒的病例很少见，猪流感病毒通常不在人际间传播。
2005年12月至今年1月，美国只发现过12例人感染猪流感病例，其中11人与猪有过直接接触。在人际传播时，科学家指出，打喷嚏、咳嗽和物理接触都有可能导致新型猪流感病毒在人群间传播。
