综合临床和细菌学检查的某些特点可考虑该病的诊断。
1.临床提示有厌氧菌感染可能的某些特征
(1)任何接近正常可有厌氧菌寄殖的黏膜面，如结肠、阴道和口咽部的感染。
(2)分泌物具典型的腐臭，但无此臭味者尚不能排除50%的病例可无此气味。
(3)存在组织严重坏死、脓肿、筋膜炎或坏疽。
(4)病变组织或渗出物中有气体。
(5)常规血液(需氧)培养结果阴性的感染性心内膜炎。
(6)感染继发于恶性肿瘤(尤结肠、子宫和肺部等处)或其他引起组织破坏的疾病者。
(7)氨基糖苷类和β-内酰胺类抗生素应用后发生的感染。
(8)伴发化脓性血栓性静脉炎。
(9)继发于人或动物咬伤后的感染。
(10)血性渗出物呈黑色，在紫外线下可发红色荧光(产黑色素普氏菌或卟啉单胞菌感染)。
(11)分泌物中有硫黄颗粒存在(放线菌感染)。
(12)有提示厌氧菌感染的某些临床表现，如败血性流产吸入性肺炎、肠道手术后感染等。
(13)典型临床表现，如气性坏疽、放线菌病和肺脓肿等。
2.细菌学检查提示有厌氧菌感染可能的某些线索
(1)渗出物革兰染色或培养所见菌落，具有形态学特征。
(2)脓性标本常规培养无细菌生长(在硫乙醇酸钠肉汤培养基中或琼脂深处可有细菌生长)，革兰染色则见到细菌。
(3)在含卡那霉素和万古霉素的培养基中，有革兰阴性杆菌生长。
(4)在培养过程中有大量气体产生，且有恶臭。
(5)在厌氧琼脂平板上有典型菌落(如核梭形杆菌和产气荚膜梭菌)，刚长出的产黑色素普氏菌菌落于紫外光下呈红色荧光。
(6)气相色谱分析呈现厌氧菌特有的挥发性脂肪酸。
3.基础性疾病提示可能的厌氧菌感染种类
(1)接受化疗的白血病患者，如有败血症表现伴口腔黏膜损害可能为噬二氧化碳纤维菌属(Capnocytophaga)或口腔纤毛菌(Leptotrichia buccalis)性败血症。
(2)出现中性粒细胞减少发热、呕吐、腹泻和腹痛者，可能为中性粒细胞减少性的结肠炎(neutropenic colitis)并常伴有败血症常见于败毒梭菌、第三梭菌或产气荚膜梭菌和革兰阴性微需氧杆菌鵻的混合感染。
(3)放置宫内避孕器的妇女发生盆腔感染时，多见放线菌或真杆菌感染。
(4)当肺部感染出现在下垂肺叶段，尤其是患有牙周病近期有麻醉史或吸入史者，可能为吸入性肺炎。
(5)发生褥疮感染和入侵途径不明的败血症者，致病菌常为脆弱类杆菌组厌氧菌，后者自褥疮入血。
(6)导管相关性的感染中，非厌氧菌所致者更常见，而常见的厌氧菌为短棒菌苗属和大消化链球菌。
(7)咬伤患者伤口感染的致病菌常为口腔寄殖厌氧菌和链球菌，被人咬伤者常见啮蚀艾肯菌(Eikenella corrodens)，而被动物咬伤者常为巴斯德菌属(Pasteurella spp)。
