口腔是病毒感染的常见部位.有些在临床上是明显的,主要在免疫妥协者.疱疹病毒感染将讨论于后.
经常的致病因子是链球菌.由肺部的痰接种在口腔中的结核分枝杆菌可引起口腔溃疡.梅毒可产生初发的下疳.如果不治疗可产生继发的粘膜斑和三期树胶肿淋病奈瑟菌产生牙龈和舌的灼伤样溃疡以及咽炎.面颈部的放线菌病(多块的颌骨)与真菌感染相似,但却是细菌感染脓性分泌物中的黄色(硫磺)颗粒为诊断的特征.
白色念珠菌及其相关亚种是口腔正常菌丛成员.在服抗生素(特别是广谱抗生素)或皮质类固醇者和衰弱的患者口腔中(如艾滋病患者)他们能过度生长.通常看上去念珠菌病好像干酪样凝乳状物,当擦去后,遗留粗的,出血的表面.慢性红斑型和糜烂型更难以识别.口腔和非经口的病损常出现在酵母菌病,组织胞浆菌病,球孢子菌病,隐球菌病(主要在衰弱的患者)和毛霉菌病(尤其在糖尿病患者的窦腔中).
由于菌状乳头的肥大猩红热可出现草莓舌.糙皮病出现光滑火红色的舌和口腔疼痛,口腔溃疡.出血性口腔病损可出现于多形红斑(见下文),坏血病,白血病,血小板减少性紫癜和血小板其他疾病.无故出血,唾液分泌减少和氨味,常伴有尿毒性口炎.