1、由于一些感染的问题，会引起甲状腺的疾病的出现，像是细菌性引起或是病毒性引起的，都有可能引起甲状腺疾病的发生，其中甲状腺肿大又是常会出现的一个，所以要预防感染的一些问题。
2、长期的服用某些药物也可能引起疾病的而出现，所以对于甲状腺囊肿的疾病也不要乱吃药物。还有自身的免疫不够，易引发甲状腺囊肿的出现，如毒性弥漫性甲状腺肿和慢性淋巴细胞性甲状腺炎。
3、引起甲状腺囊肿的先天因素，可能是某些酶的先天缺乏，在甲状腺摄碘、碘与酪氨酸的结合、碘化配种2氨酸的耦联以脱碘和碘的再利用等方面发生障碍，影响甲状腺激素，TSH分泌增多，刺激甲状腺增生肿大。
4、环境污染，有时甲状腺囊肿与环境因素的问题有很大的关系，像是百姓喝的饮用水被污染了，这样的因素就会导致一些疾病的发生，像是一些的废水、废物污染饮用水源时也可以引起甲状腺肿大。
5、由于身体吸取的碘减少，血中甲状腺素浓度因之降低，通过神经—体液调节途径，使垂体前叶分泌多量的促甲状腺素，促使甲状腺肿大，这种肿大实际上是甲状腺的代偿性肿大，是甲状腺功能不足的现象。
