随着地理位置南移，江河中的温带鱼类越来越多，冷水性鱼类则逐渐减少。辽河水系约有鱼类70种，其上游尚有北方种类;黄河水系约有140种，长江水系约有300种，二者的冷水鱼类极少，除常见的青、草、鲢、鳙、鳊、鲂、鳤、赤眼鳟、胭脂鱼等重要经济鱼类外，还有鲥鱼等特有种。
黄河、长江水系的上游和西北高原的一些河流，由于地形的原因，鱼的种类很是特殊，如鲤科的裂腹鱼属有13种，裸裂尻鱼属有8种。本地特有种有花斑裸鲤、新疆重唇角、中华锯倒刺鲃及白甲鱼等。
珠江水系的鱼类资源丰富，共约260余种，除全国广布种外，还有一些特殊类型的鱼，如波鱼属、大海鲢等，华南地区特有的种属如鲮鱼、傜山鱼、四须盘、直口鲮、唐鱼 、华南鲤等。
我国西南部的高原河流，如雅鲁藏布江、怒江、澜沧江、金沙江等，许多地段水流湍急，鱼类资源一般。如鲤科的野鲮属、东坡鲤属、鲮属等，鳅科的平鳍鳅属、沙鳅属、科的外口鮡属等，这些都与印度、缅甸、越南、泰国的种类相同。另外裂腹鱼属、裸裂尻鱼属，巴鳅属都与西北高原的种类相同。
