1.输卵管炎症
可分为输卵管粘膜炎和输卵管周围炎症，这两种炎症都是导致输卵管妊娠的常见原因。如果是严重的输卵管粘膜炎，会造成管腔完全阻塞，导致不孕；如果是轻度的输卵管粘膜粘连和纤毛缺陷，会影响受精卵，使其无法在此着床。导致输卵管感染的最常见原因是淋病和沙眼衣原体，它们常常涉及粘膜，以及流产或分娩后的卵巢周围感染。
2.输卵管手术
输卵管绝育术后如形成输卵管复通或瘘管，特别是腹腔镜下电凝输卵管绝育术、硅胶环套等，可导致输卵管妊娠的复发；因不孕症进行过输卵管分离粘连、输卵管吻合术、输卵管开口术等输卵管整形术，其复发率为10%～20%。
3、输卵管发育不良或功能异常
输卵管发育不良常表现为输卵管过长，肌层发育不良，粘膜纤毛缺乏。还有一些是双侧输卵管、憩室或存在降落伞，这些都可以成为输卵管妊娠的原因。如果雌激素和孕激素的分泌不正常，会影响受精卵的正常运行。此外，精神因素也可引起输卵管痉挛和蠕动异常，干扰受精卵的运送；
4.受精卵游走
卵子在一个输卵管内受精，受精卵经子宫或腹腔进入对侧输卵管，这称为受精卵游走。如果受精卵游走的时间过长，受精卵就会变大，并能在对侧输卵管内定居，形成输卵管妊娠。
5.辅助生殖技术
从最早的人工授精到目前常用的促排卵药物和体外受精-胚胎移植（1VF-ET）或配子输卵管内移植（GIFT），异位妊娠的发生率约为5%，高于一般原因的异位妊娠的发生率。相关的易感因素有术前输卵管病变、盆腔手术史、移植胚胎的技术因素、放置胚胎的数量和质量、激素环境以及胚胎移植时过多的移植液。
6.其他
周围肿瘤如子宫肌瘤或卵巢肿瘤压迫输卵管，特别是子宫内膜异位症造成输卵管和卵巢周围组织粘连，也可影响输卵管管腔的通畅性，阻碍受精卵的运行。也有人认为，胚胎本身的缺陷、流产和吸烟也与宫外孕的发生有关。
