强直性脊柱炎骶髂关节疼痛特点是休息不能缓解，活动后方能缓解，这也是与腰椎间盘突出、腰椎管狭窄、腰部外伤的区别点。强直性脊柱炎轻症者,仅会感觉骶髂关节部僵硬、肌肉酸痛。原因是肌腱、韧带与骶髂关节的骨附着点炎症，即肌腱末端炎。易误诊为腰椎间盘突出、风湿病。臀、大腿后侧疼痛易误诊为坐骨神经痛，但是强直性脊柱炎引起的下肢疼痛很少放射到膝以下。
强直性脊柱炎强直性脊柱炎交替性左右骶髂关节部位疼痛，是强直性脊柱炎中、早期最具特征性的症状。是骶髂关节固定部位深层次隐渐性疼痛，先为一侧显著，后发展为左右交替性疼痛，重者痛处在骶髂关节一点上。骶髂关节疼痛可以上移出现腰椎部疼痛，下移至坐骨疼痛或大腿髂部痛，因咳嗽、打喷嚏或其他牵动性动作而疼痛加重。开始时疼痛可以为单侧、间歇性，几个月后逐渐发展为双侧、持续性疼痛并伴有腰部僵硬。
强直性脊柱炎都侵犯骶髂关节，上行至腰椎疼痛，所以强直性脊柱炎骶髂关节疼痛常伴有腰痛和腰骶疼痛伴有晨僵。先为反复发作，间歇性或两侧交替性酸痛，随病情发展，或持续性深部隐渐性钝痛或者刺痛，伴有腰部酸痛，全身疲劳无力，其特点为休息、阴天或劳累后加重，活动、遇热后疼痛缓解。
