1.病原体感染 在这类病人中，虽然常规细菌检查不能分离出病原体，但仍可能与厌氧菌、L型曲霉菌、纳米菌或沙眼衣原体、支原体等特殊病原体感染有关。一些研究表明，这类患者的局部原核生物DNA检出率可高达77%；一些临床上的 "无菌性 "前列腺炎伴有慢性炎症和反复发作或加重的情况可能与这些病原体有关。医学上认为，前列腺炎是一种慢性疾病，其发病率较高，且多发生在中老年男性身上。
2.排尿功能障碍 有些因素引起尿道括约肌过度收缩，导致膀胱出口梗阻，形成残余尿，使尿液倒流至前列腺，不仅将病原体带入前列腺，而且直接刺激前列腺，诱发无菌性 "化学性前列腺炎"，引起排尿异常和盆腔疼痛。
许多前列腺炎患者有各种尿流动力学变化，如尿流率降低、功能性尿道梗阻、逼尿肌-尿道括约肌协同功能障碍。这些功能异常可能只是一种临床现象，其性质可能与各种潜在的致病因素有关。
3、精神心理因素 研究表明，半数以上的顽固性前列腺炎患者有明显的精神心理因素和人格特征改变。但也有不少人认为前列腺炎是一种 "不治之症"，是一种 "不治之症"。这些精神心理因素的变化可引起植物神经功能紊乱，造成后尿道神经肌肉功能障碍，导致骨盆区疼痛和排尿功能障碍；或引起下丘脑-垂体-性腺轴的功能变化，影响性功能，进一步加重症状，消除精神紧张可使症状缓解或痊愈。然而，目前还不清楚心身变化是直接原因还是次要表现。
4.神经内分泌因素 前列腺痛患者往往容易出现心率和血压的波动，提示可能与自主神经反应有关。疼痛具有内脏器官疼痛的特点。对前列腺和尿道的局部病理刺激通过前列腺的传入神经引发脊髓反射，激活腰部和骶部髓质的星形细胞，神经冲动通过生殖-股部和髂部神经发出冲动。和交感神经末梢释放去甲肾上腺素、前列腺素、降钙素基因相关肽和P物质，引起膀胱尿道功能紊乱，导致会阴和盆底肌肉活动异常，前列腺外相应部位出现持续性疼痛和牵涉痛。
5.免疫反应异常 最近的研究表明，免疫因素在III型前列腺炎的发展和过程中起着非常重要的作用，某些细胞因子，如IL-2、IL-6、IL-8、IL-10、TNF-α和MCP-1的水平变化可发生在患者的前列腺液和/或精浆和/或组织和/或血液中，IL-10水平与III型前列腺炎患者的水平相似。水平与III型前列腺炎患者的疼痛症状呈正相关，应用免疫抑制疗法有一定效果。
6.氧化应激理论 在正常情况下，体内氧自由基的产生、利用和清除处于动态平衡状态。前列腺炎患者体内氧自由基产生过多或/和自由基清除系统的作用相对降低，从而降低了机体对氧化应激的反应能力，增加了氧化应激的产物或/和副产物，这也可能是发病机制之一。
7.盆腔相关疾病因素 部分前列腺炎患者常伴有前列腺周围静脉丛扩张、痔疮、精索静脉曲张等，提示部分慢性前列腺炎患者可能存在盆腔静脉充血和血液淤积的相关症状，这也可能是导致治疗时间延长的原因之一。
