治疗初期：将口腔内所有脏东西尽量去除，包括病人本身口腔卫生清洁的完全配合，包括牙刷及牙线等，清洁工具的正确使用。而后以全口超音波洗牙，牙周囊袋深部结石的刮除及牙根整平术，去除不良物、咬合干扰等。
手术期：比较严重的患部，尤其牙周囊袋较深之处，需做牙周翻瓣术，方能彻底将结石及病变组织清除。牙周手术是一种局部而又安全的手术。
局部麻醉下，将牙龈稍微翻开，牙周深部的结石、肉牙组织彻底清除，若有骨损失，可配合放置牙周再生膜及人工骨粉使破坏的骨组织再生，达到积极重建牙周组织的目的。
持久期：再经历上述的治疗后，通常花了三个月至半年的时间，投注了这么多的时间与心力于其上，维持成果是极其重要的。除了要长期不间断地做口腔清洁外，应依医师指示，定期回诊检查，以充分掌握牙周及口腔情况。
1.局部治疗
(1)沽治：控制菌斑，去除局部刺激物，用沽刮术去除牙石。
(2)药物：牙周袋及根面药物处理，刮除龈下牙石后，对内壁的病理性肉芽用探针蘸腐蚀性药物(如碘酚)进入牙周袋达到治疗效果。
(3)手术：手术清除牙周袋，牙周袋不深者可将牙周袋切除，深牙周袋可采用内壁刮除术、切除新附着术、翻辨术等。
(4)固定松牙，形成牙周夹板，注意控制菌魔，拔除不能保留的病牙。
2。全身治疗：选用促使牙周组织修复及辅助改善炎症的药物，如牙周宁、中药固齿剂、维生素类药、灭滴灵、螺旋霉索等。
