1、预防秋季腹泻主要应防止着凉，尤其要防止疲劳后着凉，因为疲劳使身体免疫力下降，小儿因消化系统发育还不成熟，特别是腹壁及肠道缺乏脂肪“保暖层”，因而容易受较凉空气的刺激而引起肠蠕动增加，导致便次增加和肠道水分吸收减少，大便稀溏，病毒也容易乘虚而入，造成秋季腹泻。
2、预防小儿秋季腹泻应注意饮食及喂养，最好以母乳喂养，尤其在婴儿出生后的最初几个月及第一个夏季最为重要，尽量避免夏季断奶;注意饮食卫生，防止病从口入;合理喂养、定时定量，按时添加辅食，切忌几种辅食一起添加;食欲不振或发热早期，应减少小儿的奶量及其它食物，并以糖盐水代替，减轻胃肠道的负担，避免过食或喂富有脂肪的食物。
3、不要带小儿到人多的公共场所去，避免接触病儿。小儿使用的玩具，和能够触摸到的家具，要勤用清水冲洗，吃东西前一定要洗手，家长在为孩子吃奶或吃饭前也要把手洗干净，要用流动水冲洗。
4、加强小儿体格锻炼，增强小儿体质。及早治疗小儿的营养不良、佝偻病等一些易致慢性腹泻的疾病，同时要加强护理;不要长期应用广谱抗生素，以避免肠道内正常菌群的失调;也可到各防疫站接种疫苗。
