正常情况下，通过鼻腔呼吸的气流是沿鼻中隔以层流的形式进入。鼻中隔偏曲患者的鼻腔结构改变、畸形，气流进入鼻腔形成漩涡，气流扰乱，使得变应原积聚，浓度增高，滞留时间延长。鼻中隔偏曲的突起部更易更多受到气流的冲击，喷嚏反射弧的敏感性增高。此外，过敏性鼻炎的发病除了抗原抗体反应外，还与植物神经系统有关，双侧鼻腔长期不均匀刺激，很容易导致鼻腔副交感神经的兴奋性增高。纠正鼻内解剖结构异常，去除鼻中隔偏曲的因素后，解除了鼻道不同程度的阻塞。
当呼吸气流顺畅，可以减轻鼻腔黏膜的炎症及鼻腔黏膜腺体分泌和血管神经反应性，减少了嗜酸性粒细胞及嗜碱性细胞的分泌，缓解炎症性鼻黏膜水肿和血管扩张，从而使临床症状得以缓解。因此，伴有鼻中隔偏曲的过敏性鼻炎患者的手术治疗疗效要明显优于未行手术治疗的疗效；而同样行手术治疗，伴有鼻中隔偏曲的过敏性鼻炎患者的远期疗效优于不伴有鼻中隔偏曲的过敏性鼻炎患者。
在手术过程中破坏筛前神经副交感纤维和鼻黏膜神经末梢，也降低了鼻黏膜的反应性阻滞过度兴奋的副交感神经对血管和腺体的作用，对提高疗效有一定的作用。
