⒈染色体变异
受精并非精子和卵子的简单结合。23对染色体必须成功结合才能构成一个胚胎。在这复杂的结合过程中，一个小小的错误就会导致基因的严重变异。而基因变异导致的直接结果就是胚胎无法存活。如果结合过程中的错误发生得较早，你可能根本察觉不到自己怀孕，受精卵就被排出体外了，而形式就像来了一次月经;如果发生得较晚，其结果将是萎亡孕卵，甚至是一个没有心跳的胎儿。
⒉激素分泌失调
正常排卵依赖于各种激素的正常分泌，每种激素都在其中发挥着重要作用。15%的习惯性流产患者存在月经期激素分泌失调的症状，即某一种或几种激素分泌过多或过少，最常见的情况是黄体酮和雄性激素出现问题。以黄体酮为例，如果这种激素分泌量不足将导致受精的卵子无法正确地在子宫内着床。美国休斯顿市贝勒医学院妇产科教授sandra carson指出：“卵子发育异常有可能导致黄体酮分泌不足。”
⒊子宫病症
子宫内部组织的问题也可能导致流产，而女性通常到了怀孕的时候才会发现这些问题。子宫肌瘤就是元凶之一。大多数子宫肌瘤长在子宫外壁上，因而不会对怀孕造成什么威胁。但是那些长在子宫内的肌瘤则会抢占胚胎发育所需的空间，并且影响到胚胎的血液供应。另一种可能影响怀孕的子宫疾病出在隔膜上，它将阻止卵子正确着床，并且阻断流向胎盘的血液。宫颈无力也是导致流产的原因之一，由于宫颈缺乏力度有可能无法承受发育中的胎儿的重量。许多宫颈无力的孕妇在怀孕后的头3个月里不会出现什么症状，但是4至6个月期间就有可能流产。
⒋慢性病
在怀孕期间保持良好的健康状况是至关重要的，但是对于患有慢性病的女性来说做到这一点很困难。习惯性流产中有6%是由严重的糖尿病、甲状腺分泌失调或是心脏、肾脏、肝脏疾病等引起的。但是母体健康状况不佳并不意味着无法养育健康的宝宝。患有慢性病的孕妇可以在有经验的产科医生的指导和监控下正常分娩。
⒌免疫系统机能不良
孕妇的身体应该是一个理想的孵化器——一个温暖的充满营养的地方，而在这里最为关键的还是安全。但是，如果母体出现免疫系统失调情况就不同了，那些帮助母体抵抗病毒的抗生素将传导给胎儿并且毁灭这个正在成长的小生灵。专家对于免疫系统机能不良导致流产的可能性存在不同看法。许多医生认为，不到5%的习惯性流产是由于免疫系统问题导致的。另有一些专家则认为，50%不明原因的流产是由免疫系统失调引起的。但是，专家一致认为一种名为apls的免疫系统综合征有可能阻碍怀孕。患有apls综合征的女性体内能够产生在必要的时候引起血液凝结的抗体，这对于正在发育中的胚胎是致命的打击。apls综合征可以通过服用儿童剂量的阿司匹林或是注射血液稀释剂加以治疗。
