甲减
许多地甲肿患者临床甲功多正常(代偿)，但应用放免技术测定激素以来，证实多数甲肿患者，甚至非甲肿患者都有程度不同的甲减改变。在贵州省麻江县的调查结果值得重视，有甲肿的18例孕妇中，他们所生孩子的新生儿甲低检出率达38.9%。刘家骝、谭郁彬还在国际上首次提供了胎儿在缺碘地区的甲功变化。他们对该省30例流产胎儿的检查发现，其中23例显示T4下降，TSH升高，这些都无疑会造成程度不同的脑发育障碍。
甲亢
地甲肿病人中甲亢的发病率并不高，仅见于40岁以上的有毒性结节性甲肿的患者。这种甲亢与一般甲亢的症状相同，放射性核素扫描可以发现浓集碘的热结节，症状一般比Graves病轻，易治愈，手术后不易复发。
甲状腺癌
甲状腺癌是否与地甲肿有关，一直有争论。谭郁彬报道河北省隆化县997例结节性甲肿中甲状腺癌的发病率为1.2%，马宵在陕西的3304例中发现也只有1.59%，这个发病率并不比非病区高。值得高度重视的是，结节性甲状腺肿癌变的可能性要大，特别是单个结节。从全世界的报道看，缺碘地区的滤泡癌和未分化癌(anaplastic)发病率高，而乳头状癌的发病率低;然而补碘后，在碘充足或高碘地区，滤泡癌和未分化癌发病率低，但乳头状癌的发病率高。
气管软化
气管软化是肿大的甲状腺长期压迫气管的结果，质地坚硬或钙化的甲状腺结节直接压迫气管是造成软化的主要因素。病人的主要症状是呼吸困难(71.6%)，甚至不能平卧(16.4%)，半数以上患者还有心慌、气促等心血管系统症状。马宵在陕西省对1.15万地甲肿手术治疗时，统计了甲状腺的并发症。
大脖子病的另一个并发症为滤泡细胞性退行性癌及其肉瘤，用碘补充治疗后，其发生率下降，且病程向良性化增加。
